國內(nèi)首批CosMx SMI WTX高通量轉(zhuǎn)錄組實(shí)測數(shù)據(jù)出爐
在空間組學(xué)領(lǐng)域，CosMx SMI（Spatial Molecular Imager）平臺以其超高分辨率和強(qiáng)大通量受到廣泛關(guān)注。該平臺能夠在組織原位水平，實(shí)現(xiàn)對單細(xì)胞水平RNA的多重、高靈敏度檢測，為研究者提供解析組織微環(huán)境和細(xì)胞間相互作用的強(qiáng)有力工具。
儀器運(yùn)行過程中
Human Whole Transcriptome Panel（WTX）是SMI平臺上最高通量的轉(zhuǎn)錄組檢測解決方案，覆蓋約18,000個人類基因，實(shí)現(xiàn)對組織全轉(zhuǎn)錄組編碼基因的原位檢測。借助WTX，科研人員不僅可以獲得全面的基因表達(dá)圖譜，還能解析復(fù)雜組織中細(xì)胞類型、功能狀態(tài)以及微環(huán)境之間的精細(xì)互動，為疾病研究和機(jī)制探索提供堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)支撐。
相比于靶向Panel，WTX的優(yōu)勢在于無偏探索，它能夠讓研究者在不預(yù)設(shè)基因集合的前提下，全面掃描組織中的分子特征，從而更容易捕捉到新型細(xì)胞亞群、未知通路以及潛在的生物標(biāo)志物。這使得WTX在腫瘤免疫、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、發(fā)育生物學(xué)及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域都展現(xiàn)出廣闊應(yīng)用前景。
WTX實(shí)驗(yàn)上機(jī)準(zhǔn)備過程
技術(shù)進(jìn)展
讓我們一起領(lǐng)略亞細(xì)胞分辨率視角下，全轉(zhuǎn)錄組編碼基因的空間表達(dá)分布全貌。
統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示，檢測組織樣本在WTX和6K panel下對比，每個細(xì)胞平均轉(zhuǎn)錄本和基因檢測數(shù)提升超過50%（僅為同類型組織統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)）。
CITC中心實(shí)驗(yàn)室憑借過硬的專業(yè)技術(shù)實(shí)力和豐富的CosMx SMI 6K panel實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)，針對WTX全轉(zhuǎn)錄組服務(wù)，已構(gòu)建覆蓋樣本處理至數(shù)據(jù)分析的全流程閉環(huán)體系，各環(huán)節(jié)銜接緊密無斷點(diǎn)，同時具備多類型樣本的高度適配能力。這不僅展示了我們在空間組學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)積累和執(zhí)行力，更意味著實(shí)驗(yàn)室能夠?yàn)楹献骰锇楹涂蒲锌蛻籼峁└呔S度、更全面、更精準(zhǔn)的空間分子信息。
WTX數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞分割過程中
未來，我們期待借助SMI平臺的單細(xì)胞空間全轉(zhuǎn)錄組檢測能力，攜手推動對疾病發(fā)生發(fā)展機(jī)制的深入剖析，探索組織微環(huán)境的空間異質(zhì)性，乃至為臨床轉(zhuǎn)化研究提供堅(jiān)實(shí)的分子依據(jù)。
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