超分辨率熒光顯微鏡技術(shù)為細胞級超分辨率成像提供了新工具
該論文聚焦于超分辨率熒光顯微鏡技術(shù)，特別針對4Pi單分子定位顯微鏡（4Pi-SMSN）系統(tǒng)，提出了一種新型定位算法PR-4Pi。該算法結(jié)合相干瞳孔函數(shù)建模和光片照明技術(shù)，顯著提升了三維分辨率，實現(xiàn)了理論信息極限的定位精度。研究通過實驗驗證，在復雜生物樣本如線粒體蛋白成像中，展示了分辨率的全面提升，為細胞級超分辨率成像提供了新工具。
重要發(fā)現(xiàn)者包括Sheng Liu和Fang Huang，其成果以《Enhanced 4Pi single-molecule localization microscopy with coherent pupil based localization and light sheet illumination》為題。
重要發(fā)現(xiàn)
01PR-4Pi定位算法的核心貢獻
論文的核心創(chuàng)新在于開發(fā)了PR-4Pi（Phase-Retrieved 4Pi）定位算法，該算法基于相干瞳孔函數(shù)來建模4Pi系統(tǒng)的點擴散函數(shù)（PSF）。傳統(tǒng)4Pi顯微鏡利用雙物鏡干涉檢測，生成復雜的干涉PSF模式，但以往方法僅利用中心瓣信息，丟棄了大量側(cè)瓣光子，導致信息損失。PR-4Pi算法通過相位檢索技術(shù)，獨立獲取上下干涉路徑的瞳孔函數(shù)，從而準確模擬包含像差、傳輸損失和部分相干性的真實PSF。這一模型允許使用最大似然估計器（MLE）提取單分子位置，達到Fisher信息理論預測的Cramér-Rao下界（CRLB），即理論極限定位精度。
基于相干、相位恢復光瞳的4Pi-PSF模型
實驗過程中，研究團隊首先通過成像100納米熒光珠標定系統(tǒng)，比較了PR-4PiPSF模型與理想PSF模型。結(jié)果顯示，PR-4Pi模型與實驗PSF的交叉相關(guān)性高達0.9以上，而理想模型在離焦區(qū)域相關(guān)性顯著下降，驗證了PR-4Pi的準確性。進一步，在單分子定位測試中，PR-4Pi算法在低光子計數(shù)（約600光子/物鏡）條件下，實現(xiàn)了軸向定位精度達3-6納米，橫向精度達4-18納米，較傳統(tǒng)對比度方法提升1-4倍，且偏差降低2-6倍。
02腔相位漂移的動態(tài)校正技術(shù)4Pi系統(tǒng)的一個獨特挑戰(zhàn)是腔相位漂移，即由溫度波動引起的光路長度變化，會導致PSF模式快速變形。論文發(fā)現(xiàn)，每秒0.04弧度的漂移在10秒內(nèi)就會引起約18納米的軸向分辨率劣化。PR-4Pi算法通過短時數(shù)據(jù)批處理（每10秒），校準腔相位φ0，并利用樣條插值生成時間依賴的PSF模型，實現(xiàn)動態(tài)補償。在細胞成像中，該方法將軸向漂移控制在5納米以內(nèi)，避免了圖像偽影。對于多光學層析成像，算法還考慮了樣本掃描引入的相位變化，通過公式φd=4πn_imm d N_step/λ0 (1-n_med²/n_imm²)進行校正，確保全細胞體積成像的連續(xù)性。
03光片照明技術(shù)的背景抑制
為減少熒光背景，論文開發(fā)了4Pi兼容的高傾斜光片（Hi-LS）照明方法。傳統(tǒng)epi照明在厚樣本中產(chǎn)生高背景（約85光子），而Hi-LS通過分光路徑，在上物鏡使用epi照明定位區(qū)域，下物鏡生成傾斜光片（厚度約2.3微米），將背景降低至15光子，降幅超5倍。理論計算顯示，背景減少可提升定位精度1.4-1.7倍。在COS-7細胞的TOM20蛋白成像中，Hi-LS結(jié)合PR-4Pi算法，使聚類結(jié)構(gòu)更清晰，軸向定位范圍擴展至1.4微米，分辨率在三維維度均得到增強。
COS-7細胞中線粒體（TOM20）單平面成像的SMSN重建
04實驗驗證與生物成像應(yīng)用在生物樣本驗證中，研究對免疫標記的COS-7細胞線粒體蛋白TOM20進行成像。單光學層析數(shù)據(jù)使用160個時間依賴的PR-4PiPSF模型，多層層析使用240個模型，結(jié)果顯示PR-4Pi算法能更精確對齊光學層，聚類亮度更高，定位接受率提升。與對比度方法相比，PR-4Pi在橫向和軸向均能解析亞百納米結(jié)構(gòu)，如線粒體膜蛋白的緊密排列。此外，算法通過鬼影減少程序，將偽定位比例控制在2%以下，提升了重建可靠性。
創(chuàng)新與亮點
01突破復雜PSF信息利用難題
論文的核心突破在于解決了4Pi-PSF復雜模式的信息提取難題。傳統(tǒng)方法忽略干涉條紋，僅用高斯掩模或中心矩處理，導致信息利用率不足50%。PR-4Pi算法通過像素級Fisher信息分析，揭示干涉PSF在軸向和橫向上信息量提升20-160倍和4-7倍，從而首次實現(xiàn)全模式信息利用。這一創(chuàng)新使系統(tǒng)在低信噪比下仍保持高精度，突破了干涉顯微鏡長期存在的“信息浪費”瓶頸。
02新成像技術(shù)集成
技術(shù)亮點包括相干瞳孔建模與光片照明的協(xié)同創(chuàng)新。PR-4Pi算法不僅建模靜態(tài)像差，還引入部分相干性因子（a≈0.8）和強度比（It=1），使PSF模型在樣本深度變化時保持穩(wěn)定。光片照明設(shè)計通過圓柱透鏡和掃描鏡調(diào)控，實現(xiàn)大視野（22×8微米²）下的薄層激發(fā)，較傳統(tǒng)HILO照明厚度減少3倍。這種集成技術(shù)將光學系統(tǒng)的理論優(yōu)勢轉(zhuǎn)化為實際成像增益，為活細胞動態(tài)研究奠定基礎(chǔ)。
在光學生物醫(yī)療領(lǐng)域，該技術(shù)提升了超分辨率成像的實用性和可及性。通過實現(xiàn)10-15納米各向同性分辨率，PR-4Pi系統(tǒng)能解析細胞器如線粒體的納米級結(jié)構(gòu)動態(tài)，有望應(yīng)用于病理研究如神經(jīng)退行性疾病中的蛋白聚集觀測。此外，算法開源和動態(tài)校正設(shè)計降低了系統(tǒng)運維成本，使干涉顯微鏡更易推廣至臨床前研究。
總結(jié)與展望
本研究通過PR-4Pi算法和光片照明技術(shù)，顯著提升了4Pi單分子定位顯微鏡的分辨率和魯棒性。論文不僅實現(xiàn)了理論信息極限的定位精度，還解決了腔相位漂移和背景噪聲等實際問題，在生物成像中展示了亞細胞結(jié)構(gòu)的高清可視化。未來，該技術(shù)可進一步結(jié)合深度學習優(yōu)化PSF建模，拓展至多色標記和活體成像場景，推動超分辨率顯微鏡在精準醫(yī)療和細胞生物學中的廣泛應(yīng)用。同時，開源代碼的發(fā)布將促進技術(shù)迭代，助力光學成像領(lǐng)域的新突破。
聲明：本文僅用作學術(shù)目的。
Liu S, Huang F. Enhanced 4Pi single-molecule localization microscopy with coherent pupil based localization. Commun Biol. 2020 May 8;3(1):220. doi: 10.1038/s42003-020-0908-2. Erratum in: Commun Biol. 2020 May 29;3(1):280.
DOI:10.1038/s42003-020-1020-3.
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