講座邀約:SpatialX解析腫瘤微環(huán)境與T細(xì)胞分化的關(guān)聯(lián)
免疫檢查點(diǎn)阻斷療法已在多種癌癥的治療中展現(xiàn)出較好的臨床效果，然而在頭頸癌中患者無應(yīng)答率仍居高不下。臨床數(shù)據(jù)顯示，盡管腫瘤組織內(nèi)存在大量CD8⁺ T細(xì)胞浸潤，但僅有約10%的患者能獲得持久療效。
最新研究揭示，T細(xì)胞的功能狀態(tài)不僅取決于其克隆特性，更與其在腫瘤微環(huán)境中所處的空間位置密切相關(guān)：靠近腫瘤的區(qū)域可能驅(qū)動T細(xì)胞耗竭，而定位于特定免疫生態(tài)位則有助于維持記憶功能。理解這種空間背景，是提高免疫治療應(yīng)答率的關(guān)鍵。
主要內(nèi)容：
本次線上講座將以McCord等人于2025年發(fā)表的頭頸癌研究為案例，利用SpatialX平臺探索以下問題：
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1. 繪制腫瘤微環(huán)境的空間異質(zhì)性圖譜
如何通過關(guān)鍵標(biāo)記基因（如T細(xì)胞耗竭/記憶相關(guān)基因）的空間表達(dá)模式，在組織中識別免疫活化區(qū)與腫瘤富集區(qū)？ -
2. 細(xì)胞間空間鄰近性分析
如何量化效應(yīng)T細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞的空間距離，并評估空間鄰近性對T細(xì)胞功能分化的動態(tài)影響？ -
3. 細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò)的解析
如何識別微環(huán)境中的信號發(fā)送與接收細(xì)胞群，并鑒定驅(qū)動細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)變的關(guān)鍵配受體？
時(shí)間：2026年1月8日(周四)15:00-16:00
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SpatialX是一款集成化空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析平臺，支持CosMx、Xenium、Visium、MERSCOPE等多種主流空間組學(xué)平臺的數(shù)據(jù)。通過NVIDIA GPU加速技術(shù)實(shí)現(xiàn)高性能計(jì)算，提供直觀的用戶界面和全面的分析工具集。支持?jǐn)?shù)據(jù)快速可視化、自動化細(xì)胞注釋、細(xì)胞與區(qū)域分割、細(xì)胞通訊及差異表達(dá)分析等功能。用戶無需編程經(jīng)驗(yàn)，即可高效完成從數(shù)據(jù)到生物學(xué)解讀的全流程分析，可為腫瘤研究、免疫微環(huán)境探索與藥物開發(fā)提供有力支持。
參考文獻(xiàn)
[1] Luoma A. M., Suo S., Wang Y., et al. Tissue-resident memory and circulating T cells are early responders to pre-surgical cancer immunotherapy[J]. Cell, 2022, 185: 2918-2935.
[2] McCord, K. A., Kan, E., Hyslop, S., et al. Single-cell, spatially-resolved TCR profiling links T cell phenotype and clonality in human tumors[J]. bioRxiv, 2025: 2025.08.06.668925.
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