完整類器官三維結(jié)構(gòu)超分辨成像技術(shù)解碼神經(jīng)發(fā)育障礙病理機制
LIS1無腦回畸形作為一種神經(jīng)發(fā)育障礙，其臨床嚴重程度的差異性機制一直未被完全闡明。本研究創(chuàng)新性地結(jié)合患者來源額葉類器官與先進光學成像技術(shù)，首次實現(xiàn)了疾病嚴重程度的體外可視化建模。通過高分辨率顯微成像系統(tǒng)，研究團隊觀察到不同嚴重程度類器官在腦室區(qū)結(jié)構(gòu)、細胞排列和神經(jīng)元分布上的顯著差異，為理解疾病表型差異提供了直觀證據(jù)。研究特別注重光學成像技術(shù)的創(chuàng)新應用：利用全組織光片顯微鏡技術(shù)，實現(xiàn)了完整類器官的三維結(jié)構(gòu)解析；通過免疫熒光多重標記，同步展示了微管穩(wěn)定性、細胞連接蛋白和應激標志物的空間分布；結(jié)合WNT-GFP報告基因系統(tǒng)，動態(tài)監(jiān)測了信號通路活性的時空變化。這些成像方法的綜合運用，使研究能夠在亞細胞水平捕捉到疾病相關(guān)病理變化。
本研究由Lea Zillich、Matteo Gasparotto、Andrea Carlo Rossetti、Olivia Fechtner等15位主要研究者共同完成，論文題為《Capturing disease severity in LIS1-lissencephaly reveals proteostasis dysregulation in patient-derived forebrain organoids》，于2025年10月在《Nature Communications》期刊正式發(fā)表。
重要發(fā)現(xiàn)
01疾病嚴重程度分級與類器官模型構(gòu)建
研究團隊從63例LIS1無腦回畸形患者中篩選出7例代表不同嚴重程度（Dobyns分級1級（重度）至5級（輕度））的病例，將其體細胞重編程為誘導多能干細胞（iPSCs），并進一步培育成額葉類器官。通過這種分層設(shè)計，研究成功模擬了從輕度皮層增厚到近乎完全無腦回畸形的臨床嚴重譜系。
利用亮場成像、全組織澄清技術(shù)和激光片層掃描顯微鏡對類器官進行系統(tǒng)分析，發(fā)現(xiàn)嚴重程度相關(guān)的腦室區(qū)結(jié)構(gòu)破壞。輕度類器官尚能形成規(guī)則的神經(jīng)上皮環(huán)狀結(jié)構(gòu)，而重度類器官則表現(xiàn)為邊緣不規(guī)則、細胞向外突起。免疫組化分析顯示，重度類器官中神經(jīng)元帶顯著增加，提示存在早熟神經(jīng)分化。對腦室區(qū)六個形態(tài)參數(shù)的量化分析進一步證實，嚴重程度越高，腦室區(qū)結(jié)構(gòu)破壞越顯著。
03單細胞轉(zhuǎn)錄組學解析細胞命運改變
通過單細胞RNA測序技術(shù)，研究團隊在類器官中鑒定出包括神經(jīng)上皮細胞、放射狀膠質(zhì)細胞、中間祖細胞和各類神經(jīng)元在內(nèi)的10個主要細胞群體。嚴重病例中出現(xiàn)了一個獨特的過渡性放射狀膠質(zhì)細胞群體，同時伴隨神經(jīng)祖細胞減少和中間神經(jīng)元增加的比例變化。偽時間分析證實了患者類器官中存在早熟的神經(jīng)上皮向放射狀膠質(zhì)細胞向神經(jīng)元的轉(zhuǎn)化軌跡。
04蛋白質(zhì)組學揭示LIS1蛋白劑量效應
采用無標記質(zhì)譜技術(shù)對皮質(zhì)祖細胞進行蛋白質(zhì)組學分析，發(fā)現(xiàn)LIS1蛋白水平隨疾病嚴重程度呈漸進性下降。雖然重度組患者的臨床表型更為嚴重，但其祖細胞中的LIS1蛋白水平略高于中度組，而轉(zhuǎn)錄水平呈現(xiàn)相反模式，提示存在轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析鑒定出兩個與嚴重程度相關(guān)的蛋白模塊，其中藍色模塊與RNA剪接、鈣粘蛋白結(jié)合和未折疊蛋白結(jié)合相關(guān)，表明蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)失衡是LIS1無腦回畸形的重要特征。
05光學成像技術(shù)驗證分子通路異常
通過免疫熒光染色和圖像分析，研究發(fā)現(xiàn)微管穩(wěn)定性標志物乙�；�α-微管蛋白的纖維密度隨嚴重程度增加而顯著降低，證實了微管 destabilization 是LIS1無腦回畸形的核心表型。
同時，N-鈣粘蛋白的分布也呈現(xiàn)嚴重程度相關(guān)的錯誤定位梯度，從輕度到重度條件下，其信號從緊密的頂端表面分布逐漸變得彌散。共聚焦顯微鏡分析顯示，WNT信號通路活性隨嚴重程度增加而降低，且細胞分裂平面方向異常比例增加，進一步證實了WNT通路在疾病發(fā)生中的關(guān)鍵作用。
創(chuàng)新與亮點
01突破性成像技術(shù)應用
本研究成功將多種先進光學成像技術(shù)應用于腦類器官分析，特別是在三維結(jié)構(gòu)成像方面取得重要突破。通過全組織澄清技術(shù)與激光片層掃描顯微鏡相結(jié)合，實現(xiàn)了對完整類器官內(nèi)部結(jié)構(gòu)的無損觀測，避免了傳統(tǒng)切片技術(shù)造成的信息丟失。這種成像方法能夠清晰顯示腦室區(qū)形態(tài)、神經(jīng)元分布和蛋白定位，為神經(jīng)發(fā)育障礙研究提供了強有力的技術(shù)支撐。
研究團隊通過高分辨率免疫熒光成像，首次在患者來源類器官中直觀展示了微管穩(wěn)定性破壞的嚴重程度梯度。利用乙�；�α-微管蛋白特異性抗體標記，結(jié)合定量圖像分析，精確量化了放射狀膠質(zhì)細胞基底過程中微管纖維的密度變化。這種顯微成像方法不僅證實了LIS1蛋白在微管穩(wěn)定中的核心作用，還為疾病嚴重程度評估提供了可靠的形態(tài)學標志。
03活細胞成像技術(shù)追蹤動態(tài)過程
研究利用WNT-GFP報告基因系統(tǒng)，實時監(jiān)測了類器官發(fā)育過程中WNT信號通路的時空動態(tài)變化。通過活細胞成像技術(shù)，發(fā)現(xiàn)嚴重程度相關(guān)的WNT信號活性降低主要發(fā)生在腦室區(qū)頂端區(qū)域，這一發(fā)現(xiàn)為理解放射狀膠質(zhì)細胞行為異常提供了重要線索。此外，通過對分裂細胞的角度測量，研究揭示了LIS1突變?nèi)绾瓮ㄟ^影響細胞分裂方向進而導致皮層結(jié)構(gòu)異常。
04多模態(tài)圖像整合分析
本研究創(chuàng)新性地將結(jié)構(gòu)成像、分子成像和功能成像數(shù)據(jù)進行了整合分析。通過配準不同模態(tài)的圖像信息，建立了從微觀細胞結(jié)構(gòu)到宏觀組織形態(tài)的跨尺度關(guān)聯(lián)，為理解LIS1無腦回畸形的發(fā)病機制提供了系統(tǒng)視角。這種多模態(tài)成像策略不僅提高了疾病模型的可信度，也為未來神經(jīng)發(fā)育障礙的影像診斷提供了新思路。
總結(jié)與展望
本研究通過患者來源的額葉類器官模型，成功模擬了LIS1無腦回畸形的嚴重程度譜系，并綜合運用多組學分析和先進成像技術(shù)，揭示了疾病發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵機制。研究發(fā)現(xiàn)，微管穩(wěn)定性破壞、細胞連接異常和WNT信號通路受損構(gòu)成了核心病理軸，而蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)失調(diào)作為新發(fā)現(xiàn)的機制，與疾病嚴重程度密切相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)不僅深化了對LIS1無腦回畸形發(fā)病機制的理解，也為相關(guān)神經(jīng)發(fā)育障礙的治療提供了新靶點。
未來研究可進一步優(yōu)化類器官培養(yǎng)系統(tǒng)，提高模型的復雜性和成熟度，以更好地模擬晚期發(fā)育事件。同時，整合更先進的活體成像技術(shù)，如光片顯微鏡和超分辨率顯微鏡，將有助于實時追蹤細胞行為和分子事件動態(tài)。在轉(zhuǎn)化應用方面，基于成像表型的高通量藥物篩選平臺有望加速治療策略開發(fā)，而蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)劑的深入研究可能為神經(jīng)發(fā)育障礙提供新的治療思路。此外，這種嚴重程度分層的研究策略可推廣至其他遺傳異質(zhì)性神經(jīng)疾病，為精準醫(yī)療時代的個體化治療提供重要參考。
論文信息聲明：本文僅用作學術(shù)目的。
Zillich L, Gasparotto M, Rossetti AC, Fechtner O, Maillard C, Hoffrichter A, Zillich E, Jabali A, Marsoner F, Artioli A, Wilkens R, Schroeter CB, Hentschel A, Witt SH, Melzer N, Meuth SG, Ruck T, Koch P, Roos A, Bahi-Buisson N, Francis F, Ladewig J. Capturing disease severity in LIS1-lissencephaly reveals proteostasis dysregulation in patient-derived forebrain organoids. Nat Commun. 2025 Oct 13;16(1):9091.
DOI:10.1038/s41467-025-64980-0.
標簽：
類器官培養(yǎng)
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