類器官是干細(xì)胞經(jīng)體外三維培養(yǎng)形成的 “微型器官”,結(jié)構(gòu)與功能貼近真實(shí)器官,能彌補(bǔ)傳統(tǒng)細(xì)胞系和動(dòng)物模型的局限,廣泛用于疾病建模、藥物篩選等領(lǐng)域。但是由于類器官本身不透明,且常規(guī)切片對(duì)結(jié)構(gòu)會(huì)產(chǎn)生損害。最近組織透明化技術(shù)的發(fā)展,使類器官研究有了更大的進(jìn)步。借助組織透明化技術(shù),可無(wú)損呈現(xiàn)類器官三維結(jié)構(gòu)與細(xì)胞分布,動(dòng)態(tài)追蹤其發(fā)育及功能響應(yīng),既提升研究精準(zhǔn)度與效率,也為疾病機(jī)制解析、個(gè)性化醫(yī)療提供關(guān)鍵支持。
2025 年,來(lái)自美國(guó)得克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心、辛辛那提兒童醫(yī)院醫(yī)學(xué)中心等機(jī)構(gòu)的研究團(tuán)隊(duì),在《Nature Communications》發(fā)表了題名為 “Cellular crosstalk mediated by TGF-β drives epithelial-mesenchymal transition in patient-derived multi-compartment biliary organoids”的研究論文。該團(tuán)隊(duì)不僅成功構(gòu)建了能精準(zhǔn)模擬人類膽道結(jié)構(gòu)與功能的多腔室膽道類器官(MBOs)模型,更借助這一模型,揭示了在新生兒膽道閉鎖(BA,一種致死性兒科膽管疾。┲,由轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子 -β(TGF-β)介導(dǎo)的細(xì)胞間通訊,是驅(qū)動(dòng)膽管上皮 - 間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)、引發(fā)膽道結(jié)構(gòu)缺陷與纖維化的關(guān)鍵致病通路。

研究的主要結(jié)果
1、模型構(gòu)建:多腔室膽道類器官(MBOs)的構(gòu)建與驗(yàn)證
將正常肝或 BA 患者肝來(lái)源的膽管上皮類器官細(xì)胞,與 HUVECs(人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞)、MSCs(間充質(zhì)干細(xì)胞)按特定比例(膽管上皮細(xì)胞 4.7×10⁵個(gè)、HUVECs 3.3×10⁵個(gè)、MSCs 1.0×10⁵個(gè))混合,接種于基底膜提取物(BME)與內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng)基(EGM)的混合基質(zhì)中,先經(jīng)擴(kuò)張培養(yǎng)基(EM)培養(yǎng) 5 天,再用膽管分化培養(yǎng)基(DM)培養(yǎng) 9 天,最終形成 3D 結(jié)構(gòu)的 MBOs(圖1)。

圖 1 MBO(多腔室膽道類器官)的構(gòu)建與檢測(cè)
a:MBO 構(gòu)建步驟示意圖(含細(xì)胞混合、擴(kuò)張培養(yǎng)、分化培養(yǎng)階段);
b-c:培養(yǎng) 5 天、10 天、14 天后 MBOs 外層細(xì)胞層面積量化結(jié)果(5-10 天外層細(xì)胞層面積增長(zhǎng) 4 倍)及相位差顯微鏡下結(jié)構(gòu)變化;
d-e: 整體免疫染色顯示 MBOs 中 CK19⁺上皮細(xì)胞(紅色)、CD31⁺內(nèi)皮細(xì)胞(綠色)、VIM⁺間充質(zhì)細(xì)胞(白色)的分布,與 3 日齡小鼠肝外膽管解剖結(jié)構(gòu)高度一致;
g-h:PEGASOS 透明化處理后,免疫染色顯示 MBO 與 3-4 日齡小鼠肝外膽管中 EPCAM(白色)和 TROP2(紅色)的表達(dá)(MBO 中 PBGs 呈 TROP2 低表達(dá) / EPCAM⁺);
i:FACS 分析結(jié)果(MBO 中 TROP2 低表達(dá) / EPCAM⁺的 PBG 細(xì)胞數(shù)量是單一上皮類器官(Mono)的 30 倍);
j:免疫染色顯示 MBOs 中 SOX9(紅色)、SOX2(紅色)、CK19(綠色)和細(xì)胞核(藍(lán)色;DAPI)的信號(hào)分布(PBG 樣結(jié)構(gòu)表達(dá) SOX9、SOX2 等祖細(xì)胞標(biāo)志物)。
通過(guò)透明化后的 3D 成像,清晰觀察到 NC-MBOs(正常 MBOs)的分層結(jié)構(gòu):外層 CK19⁺上皮細(xì)胞形成連續(xù)的膽管樣結(jié)構(gòu),中央 CD31⁺內(nèi)皮細(xì)胞和 VIM⁺間充質(zhì)細(xì)胞形成支持網(wǎng)絡(luò),PBGs(膽管周圍腺體)嵌入其中。對(duì)照實(shí)驗(yàn)顯示,僅膽管上皮細(xì)胞與 MSCs 共培養(yǎng)無(wú)法形成完整 MBO 結(jié)構(gòu),僅與 HUVECs 共培養(yǎng)則無(wú)法形成類器官,證實(shí)內(nèi)皮細(xì)胞和間充質(zhì)細(xì)胞對(duì) MBO 構(gòu)建及 PBG 發(fā)育的必要性。
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組織透明化后成像以及光片顯微鏡
2、機(jī)制發(fā)現(xiàn):BA-MBOs 中 EMT 與 TGF-β 信號(hào)的異常激活
為解析 BA 的核心致病機(jī)制,研究通過(guò)單細(xì)胞 RNA 測(cè)序(scRNA-seq)對(duì) BA-MBOs(BA 患者來(lái)源 MBOs)與 NC-MBOs 進(jìn)行對(duì)比分析,結(jié)果如下:
1.異常中間細(xì)胞群富集:BA-MBOs 中存在 3 個(gè)異常富集的 “中間細(xì)胞群”(Intermediate 1/2/4),分別高表達(dá) TGF-β 誘導(dǎo) EMT 的介導(dǎo)基因(如 LGALS1、IGFBP7)、ECM 重塑基因(如 LOX、FN1),且是 TGF-β 的主要分泌來(lái)源;
2.TGF-β3 信號(hào)過(guò)度激活:BA-MBOs 中間充質(zhì)細(xì)胞分泌的 TGF-β3 量是 NC-MBOs 的 4 倍,可通過(guò)激活上皮細(xì)胞的 SMAD2/3 通路,上調(diào) SNAI1、ZEB2 等 EMT 轉(zhuǎn)錄因子;
3.上皮細(xì)胞表型異常:EMT 激活導(dǎo)致 BA-MBOs 中上皮細(xì)胞失去極性,形成 “pan-CK⁺/VIM⁺混合細(xì)胞”,上皮極性標(biāo)志物 ZO1、E - 鈣黏蛋白表達(dá)分布異常,酸性黏蛋白分泌能力顯著下降(Alcian Blue 染色陽(yáng)性率僅為 NC-MBOs 的 1/5)。

圖 2 對(duì)類器官細(xì)胞的譜系分析
a-b:BA-MBO 與 NC-MBO 的相位差顯微鏡圖像及 CK19⁺上皮細(xì)胞數(shù)量量化(BA-MBOs 中 CK19⁺細(xì)胞數(shù)量減少 40%);
c:免疫染色對(duì)比兩種類器官的 TGF-β3 表達(dá)(BA-MBOs 中 TGF-β3 染色強(qiáng)度是 NC-MBOs 的 4 倍);
d:第 5 天和第 14 天 MBO 的 FACS 結(jié)果(第 14 天 BA-MBOs 中 pan-CK⁺/VIM⁺混合細(xì)胞數(shù)量是 NC-MBOs 的 2 倍,pan-CK⁺/VIM⁻上皮細(xì)胞數(shù)量減少 3 倍);
e:scRNA-seq 的 UMAP 圖(按細(xì)胞類型著色,含上皮細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞、間充質(zhì)細(xì)胞及 5 個(gè)中間細(xì)胞群);
f:中間細(xì)胞群的 MSigDB 通路富集結(jié)果(EMT、TGF-β 受體信號(hào)通路顯著富集);
g:各細(xì)胞群在 MBO 中的比例(BA-MBOs 中 Intermediate 2/4 細(xì)胞群占比增加 2-3 倍);
h:UMAP 圖中疊加的 EMT 評(píng)分(BA-MBOs 中中間細(xì)胞群 EMT 評(píng)分顯著高于 NC-MBOs)。
長(zhǎng)期培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)顯示,將 MBOs 培養(yǎng)至 28 天時(shí),NC-MBOs 仍維持完整上皮結(jié)構(gòu),而 BA-MBOs 中 VIM⁺細(xì)胞進(jìn)一步擴(kuò)張,上皮細(xì)胞體積減少約 3 倍,再現(xiàn)了 BA 患者膽道纖維化的進(jìn)展特征。
3、治療探索:TGF-β 抑制劑對(duì) BA 表型的逆轉(zhuǎn)作用既往恐懼經(jīng)歷促進(jìn)后續(xù)厭惡學(xué)習(xí)
體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證 TGF-β 抑制劑 A8301 對(duì) BA 表型的逆轉(zhuǎn)效果,具體結(jié)果如下:
1.體外實(shí)驗(yàn)(BA-MBOs):
(1)10μM A8301 處理后,BA-MBOs 中 pan-CK⁺/VIM⁺混合細(xì)胞數(shù)量減少 60%,pan-CK⁺/VIM⁻上皮細(xì)胞數(shù)量增加 2 倍;
(2)透明化 3D 成像顯示(圖3C),上皮層連續(xù)性恢復(fù),CK19⁺細(xì)胞形成的表面積與 NC-MBOs 無(wú)顯著差異(p>0.05),PBGs 數(shù)量和大小分別增加 2.5 倍、3 倍;
(3)上皮功能恢復(fù):ZO1、E - 鈣黏蛋白重新定位于細(xì)胞頂端,酸性黏蛋白分泌能力恢復(fù)至 NC-MBOs 的 80%。
2.體內(nèi)實(shí)驗(yàn)(BA 模型小鼠):
對(duì) RRV(恒河猴輪狀病毒)感染誘導(dǎo)的 BA 模型小鼠,腹腔注射 A8301(1mg/kg 體重 / 天),結(jié)果顯示:
(1)黃疸發(fā)生率從 80% 降至 25%,21 天存活率從 30% 提升至 75%;
(2)血清膽紅素、谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平分別降低 60%、55%;
(3)肝組織病理顯示,肝外膽管上皮完整性恢復(fù),門靜脈區(qū)纖維化程度顯著減輕(Sirius Red 染色陽(yáng)性面積減少 50%)。

圖 3 抑制TGF-β的表達(dá)對(duì)BA 表型存在恢復(fù)作用
a:A8301 體外抑制 BA-MBOs 中 TGF-β 信號(hào)的流程示意圖(含藥物處理時(shí)間、濃度);
b:FACS 定量第 14 天 A8301 處理后 MBOs 的膽管及間充質(zhì)細(xì)胞數(shù)量;
c:A8301 處理后 ,PEGASOS透明化MBOs 的免疫染色圖像(CK19:紅,CD31:綠,VIM:白)及 CK19⁺結(jié)構(gòu)數(shù)量、PBG 樣結(jié)構(gòu)大小定量;
d-f:A8301 處理后 BA-MBOs 的 E - 鈣黏蛋白表達(dá)、ZO1 表達(dá)及 Alcian Blue 染色結(jié)果(黏液分泌能力顯著恢復(fù));
g-h:BA 患者與正常對(duì)照血清中 TGF-β1/2/3 及 INHBA 的表達(dá)水平(BA 患者血清 TGF-β3 含量是正常對(duì)照的 3 倍)。
研究總結(jié)
該研究通過(guò)構(gòu)建多腔室膽道類器官(MBOs)模型,首次在體外模擬了人類膽道的雙重上皮結(jié)構(gòu)(膽管上皮 + 膽管周圍腺體),并明確了 TGF-β 介導(dǎo)的細(xì)胞間通訊在 BA 發(fā)病中的核心作用:
1.模型創(chuàng)新:MBOs 模型解決了傳統(tǒng)單一上皮類器官無(wú)法模擬膽道微環(huán)境的局限,可用于 BA 發(fā)病機(jī)制研究及藥物篩選;
2.機(jī)制突破:證實(shí) TGF-β3-SMAD2/3-EMT 通路是 BA 膽道結(jié)構(gòu)缺陷與纖維化的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)通路;
3.治療潛力:體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)證實(shí) TGF-β 抑制劑 A8301 可有效逆轉(zhuǎn) BA 表型,為 BA 的靶向治療提供了新方向。
該研究不僅為膽道疾病研究提供了更貼近生理狀態(tài)的實(shí)驗(yàn)工具,也為 BA 的臨床轉(zhuǎn)化研究奠定了理論基礎(chǔ),未來(lái)有望通過(guò) TGF-β 抑制劑聯(lián)合其他療法,改善 BA 患者的預(yù)后。
參考文獻(xiàn)
Ayabe H, DePasquale EAK, Amarachintha SP, et al. Cellular crosstalk mediated by TGF-β drives epithelial-mesenchymal transition in patient-derived multi-compartment biliary organoids. Nat Commun. 2025 Jul 17;16(1):6575. doi: 10.1038/s41467-025-61442-5.
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